Действие разворачивается в 2023 году, спустя три года после событий первой части. На Нью-Йорк обрушилась серия природных катастроф, а затем началось масштабное вторжение инопланетной расы цефов, стремящихся уничтожить человеческую цивилизацию. Город превратился в руины: улицы заполнили пришельцы, распространяется смертельный вирус, а здания охвачены огнём.