Игра (8 bit

Dr. Mario является игрой в жанре головоломки типа «три в ряд», в которой Марио берёт на себя роль врача, бросая двухцветные пилюли в бутылку, представляющую игровое поле. С помощью пилюль игроку необходимо обезвредить три разновидности вирусов, помещённые в сосуд. По манере и стилю Dr. Mario похожа на Тетрис. Каждая пилюля состоит из двух разноцветных половинок (итого в игре используются пилюли шести цветовых комбинаций, по три одноцветных и разноцветных). Вращая пилюли, игрок должен составлять ряды из вируса и трёх элементов одинакового с ним цвета. Составленная конструкция исчезает, освобождая место для продолжения игры и уничтожения оставшихся вирусов. Уровень считается пройденным, если обезврежены все вирусы. Игра заканчивается, если ряды пилюль, достигнув верха, преграждают узкое горлышко бутылки.

Игроку сначала выводится экран опций, где он может выбрать начальный уровень, скорость игры и музыкальное сопровождение. Счёт игрока основан исключительно на количестве устранённых вирусов и выбранной скорости игры, с бонусными очками за очистку большого количества вирусов в одной строке одновременно. В игре нет фиксированного конца, и игрок может проходить уровни дальше и накапливать очки даже после победы на 20 уровне.